Протокол направлен на устранение пробелов в правовом регулировании, выявленных в ходе правоприменительной практики, а также на техническую корректировку отдельных положений Договора. Ряд положений документа разработан в целях выполнения плана мероприятий по реализации Стратегических направлений развития евразийской экономической интеграции до 2025 года, утвержденного распоряжением Совета Евразийской экономической комиссии от 5 апреля 2021 г. № 4.
В частности, в Договор включаются нормы, касающиеся порядка введения государствами-членами Союза экстренных фитосанитарных мер, разработки и принятия программы совместных действий государств-членов в сфере защиты прав потребителей, правил выдачи лицензий и разрешений на экспорт и (или) импорт товаров, взаимного признания электронной цифровой подписи для целей государственных (муниципальных) закупок.
Протокол был сформирован по результатам работы в 2021-2022 годах Сводной рабочей группы по совершенствованию положений Договора о Союзе. Министерство юстиции, в свою очередь, выступает координатором деятельности органов государственного управления Республики Беларусь по данному направлению работы. В разработке Протокола приняло участие не менее 10 республиканских органов государственного управления.